Encontramos nossos heróis no meio de um dilema de proporções intergalácticas quando o último plano maligno do Dr. Nefarious deu errado deixando Ratchet, Clank, Qwark e o próprio Nefarious presos na armadilha de uma máquina poderosa e misteriosa. A contragosto, os maiores benfeitores da galáxia e seu criminoso mais sinistro devem trabalhar juntos para descobrir um meio de fuga nesta parte repleta de ação da série Ratchet & Clank.